САФ Магелан АД има двустепенна система на управление. Дружеството се управлява от:
Управителен съвет:
Анна Страхилова Иванова – Председател на УС
Тодор Василев Томов – Изпълнителен директор и член на УС
Румен Христов Камберов – Член на УС
Надзорен съвет:
Стефчо Георгиев Иванов – Председател на НС
Георги Иванов Георгиев – Заместник председател на НС
Спасимир Маджаров, представител на MEI ROEMENIE EN BULGARIJE FONDS N.V. – Член на НС